患上吉巴氏綜合症時，患者或有以下併發症：
呼吸困難：控制呼吸的肌肉有機會受抗體攻擊，部分患者留院期間需要使用呼吸機
感覺障礙：大部分患者可復元，小部分有輕微的刺痛、麻痺或無力的感覺
心跳血壓不穩：患者普遍有血壓波動及心律不正的併發症
痛症：約一半患者感到嚴重疼痛，需止痛藥治療
大小便問題：部分患者有便秘或尿瀦留併發症
血栓形成：由於患病時長期臥床，會有血栓形成的風險，需要服用薄血丸或穿著壓力襪，直至行動如常為止
褥瘡：由於長期臥床而引起，需不時轉換臥姿以預防
延髓性麻痺（bulbar palsy）：表現為構音障礙及言語困難
面肌或口咽無力：多在患者軀體或四肢受影響後出現
復發：發生在約5%患者身上
其他罕見的併發症包括呼吸窘迫綜合症及心臟病發。
一般而言，患病早期呈現的病徵愈嚴重，患者長期出現嚴重併發症的風險愈高。
參考文獻：
1. 美國Mayo Clinic網站：http://www.mayoclinic.org/diseases-conditions/guillain-barre-syndrome/basics/complications/con-20025832（Accessed on 30 August, 2015）
2. Yoshino, Hiide et al. IgG antiganglioside antibodies in Guillain–Barré syndrome with bulbar palsy. Journal of Neuroimmunology: Volume 105, Issue 2, 195 – 201
3. Medscape網站：http://emedicine.medscape.com/article/315632-clinical（Accessed on 29 September, 2015）